Při současném podání bakteriostatických antibiotik (tetracyklinů, chloramfenikolu, erythromycinu aj.) dochází ke vzájemnému antagonismu. Prokain-penicilin snižuje účinek perorálních antikoagulancí; jeho účinek snižuje chlorpromazin; hladinu penicilinu v krvi zvyšuje současné podávání salicylátů, aminofenazonu a vitaminu C. Prokain uvolněný z prokain-benzylpenicilinu může interferovat při laboratorním stanovení 17-hydroxysteroidů a 17-ketosteroidů, čímž dochází ke zkreslení výsledků. Prokain zvyšuje účinek a toxicitu antiarytmik, vazodilatancií. Při současném podání ruší účinek sulfonamidu. Toxicitu prokainu zvyšují inhibitory cholinesterázy, morfin, efedrin. Rovněž může podávání prokain-penicilinu ovlivnit výsledky vyšetření štítné žlázy.
Volně dostupný nekomerční projekt za účelem laického srovnání léčiv na úrovni interakcí, vedlejších účinků, stejně jako cen léčiv a jejich a alternativ