Přestože v pokusech na zvířatech nebyly při vysokých dávkách zjištěny žádné škodlivé účinky, má být Mucobene v těhotenství a v období kojení podáván jen tehdy, je-li to nezbytně nutné. Nejsou k dispozici odpovídající kontrolované studie u těhotných žen, proto lze podat acetylcystein v těhotenství a v období kojení pouze po pečlivém zvážení terapeutického poměru přínosu a rizika.