Lék smí být užíván pouze po pečlivém vyhodnocení rizika a prospěšnosti léčby u pacientů: - léčených inhibitory monoaminooxidázy (MAO) během posledních dvou týdnů nebo dalšími léky s potenciálně hypertenzním účinkem - se zvýšeným nitroočním tlakem, zejména u pacientů s glaukomem s úzkým úhlem - se závažným kardiovaskulárním onemocněním (např. ischemická choroba srdeční, hypertenze) - s feochromocytomem - s metabolickým onemocněním (např. hyperthyreosa, diabetes mellitus) - s porfyrií - s hyperplazií prostaty
Dlouhodobé užívání a předávkování sympatomimetiky s dekongescenčními účinky může vést k reaktivní hyperémii nosní sliznice. Tento "rebound" účinek může vést k obstrukci průchodu vzduchu, které má za následek opakované a i trvalé užívání léku pacientem. To může vést až k chronickému otoku (rhinitis medicamentosa) a následně až k atrofii nosní sliznice (ozéna). V mírnějších případech reaktivní hyperémie je možné zvážit přerušení léčby sympatomimetikem nejdříve v jedné nosní dírce a při zmírnění obtíží pokračovat v léčbě na druhé straně, aby bylo udrženo dýchání alespoň jednou nosní dírkou.
U pacientů se syndromem dlouhého QT intervalu léčených xylometazolinem může být zvýšené riziko závažných komorových arytmií.