Po orální aplikaci se resorbují až 2 % účinné látky a v nemetabolizované formě se vyloučí stejným dílem ledvinami a žlučí. Biologický poločas činí přibližně 80 minut. Ke kumulaci účinné látky v tkáních a orgánech nedochází ani při dlouhodobém užívání. Biologické membrány, např. hematolikvorová bariéra , bariéra krev - mléko, nejsou pro chromoglykát sodný propustné.