Přípravek Batrafen se obvykle nanáší 2 x denně na postižená místa a lehce vtírá.
V léčbě přípravkem Batrafen se pokračuje tak dlouho, dokud nedojde k odeznění kožních příznaků (obvykle 2 týdny). K zabránění nového výskytu onemocnění se doporučuje pokračovat v léčbě ještě až 2 týdny.