Účinek xylometazolinu začíná 5-10 minut po aplikaci a trvá až 10 hodin. Při intranasální aplikaci může být příležitostně vstřebané množství dostatečné k tomu, aby způsobilo systémové účinky, např. v centrálním nervovém systému a kardiovaskulárním systému.
Údaje z farmakokinetických studií u člověka nejsou k dispozici.