Reprodukční toxicita Studie teratogenity u myší, potkanů, křečků a králíků neodhalily žádný teratogenní potenciál.
Tumorigenní a mutagenní potenciál Chlortalidon in vitro indukuje chromozomální aberace v buňkách savců. In-vivo experimenty na myších neodhalily takové důkazy pro kostní dřeň a hepatocyty. Význam pozitivních nálezů in vitro není dostatečně objasněn. S chlortalidonem nebyly provedeny žádné dlouhodobé studie kancerogenity.