Současné podávání jiných známých nefrotoxických látek jako jsou NSAID a azathioprin, může zvyšovat riziko renálních nežádoucích účinků. V několika studiích bylo prokázáno, že současné podávání mesalazinu s azathioprinem nebo merkaptopurinem nebo thioguaninem může zvyšovat riziko myelosuprese, nicméně mechanismus interakce není zcela znám. Doporučuje se pravidelné sledování počtu leukocytů a podle toho je nutno upravit dávkovací schéma thiopurinů.
Mesalazin by mohl oslabovat antikoagulační působení warfarinu, ale důkaz je slabý.