V případě současného nedostatku vápníku je třeba nejdříve korigovat deficit hořčíku a pak teprve podávat vápník.
U středně těžké poruchy funkce ledvin je třeba přípravek podávat opatrně vzhledem k riziku hypermagnezemie.
V případě užívání vysokých dávek pyridoxinu po dlouhou dobu se může objevit senzorická axonální neuropatie (viz bod 4.9).
Přípravek Magne B6 obsahuje sacharózu. Pacienti se vzácnými dědičnými problémy s intolerancí fruktózy, malabsorpcí glukózy a galaktózy nebo se sacharózo-izomaltázovou deficienci nemají tento přípravek užívat.