Studie ukázaly, že cytarabin je v klinicky relevantních dávkách genotoxický (in vivo a in vitro), embryotoxický a teratogenní, pokud jsou mu vystaveny březí savčí samice v průběhu organogeneze. Bylo také hlášeno, že cytarabin způsobuje poškození na vyvíjející se mozek, pokud je aplikován novorozeným savčím mláďatům (období odpovídající třetímu trimestru těhotenství u člověka) a zvyšuje frekvenci abnormálních pohlavních buněk in vivo u myší. Bylo prokázáno, že cytarabin je kancerogenní u zvířat. Je nutné vzít v úvahu možnost srovnatelného účinku při rozhodování o dlouhodobé perspektivě pacientů.