Sodná sůl rabeprazolu poskytuje výraznou a přetrvávající inhibici sekrece žaludeční kyseliny. Může nastat interakce se sloučeninami, jejichž absorpce závisí na pH. Souběžné podávání sodné soli rabeprazolu s ketokonazolem nebo itrakonazolem může vést k významnému poklesu plazmatických hladin antimykotik. Proto je třeba jednotlivé pacienty monitorovat s cílem určit, zda je při souběžném podávání ketokonazolu nebo itrakonazolu s přípravkem Zulbex nutná úprava dávky.
V klinických studiích byla antacida používána souběžně s rabeprazolem, přičemž ve specifické studii lékových interakcí nebyla pozorována žádná interakce s tekutými antacidy.
Souběžné podávání atazanaviru 300 mg/ritonaviru 100 mg s omeprazolem (40 mg jednou denně) nebo atazanaviru 400 mg s lansoprazolem (60 mg jednou denně) zdravým dobrovolníkům vedlo k podstatnému snížení expozice atazanaviru. Absorpce atazanaviru závisí na pH. I když neexistují žádné studie, očekávají se podobné výsledky i s jinými inhibitory protonové pumpy. Proto se IPP včetně rabeprazolu nemají podávat souběžně s atazanavirem (viz bod 4.4).
Methotrexát Kazuistiky, publikované populační farmakokinetické studie a retrospektivní analýzy naznačují, že souběžné podávání IPP a methotrexátu (zejména ve vysokých dávkách; viz informaci pro předepisování methotrexátu) může zvýšit a prodloužit sérové hladiny methotrexátu a/nebo jeho metabolitu hydroxymethotrexátu. Nicméně nebyly provedeny žádné formální studie lékových interakcí methotrexátu s IPP.