Existují jasné pozitivní nálezy mutagenity, které ukazují, že morfin má klastogenní účinek, který se projevuje také u zárodečných buněk. Proto je morfin považován za mutagenní látku; takový účinek musí být také očekáván u člověka. Morfin se má užívat spolu s bezpečnou antikoncepcí. Dlouhodobé studie karcenogeního potenciálu morfinu na zvířatech nebyly provedeny. Několik studií prokázalo, že morfin může urychlovat nádorový růst. Ve studiích na zvířatech morfin vykazoval teratogenní potenciál a neurobehaviorální deficit u vyvíjejícího se organismu, zatímco údaje u člověka neprokázaly přítomnost malformací nebo fetotoxického účinku morfinu. U samců potkanů byla hlášena snížená fertilita a poškození chromozomů v gametách.