Akutní předávkování budesonidem by nemělo vyvolat žádné zřejmé klinické příznaky. V případě dlouhodobého podávání při použití vysokých dávek nebo při současném podávání jiných glukokortikosteroidů by mohl budesonid vyvolat systémové glukokortikosteroidní účinky, jako je insuficience nadledvin a hyperkortikalizmus.