Léčba levothyroxinem má být podávána shodně zvláště během těhotenství a v období kojení. Požadavky na dávkování se během těhotenství mohou dokonce zvýšit. Zvýšení hladiny TSH v séru se může objevit již v průběhu 4 týdnů těhotenství. Těhotné ženy užívající levothyroxin proto mají mít během každého trimestru změřenou hladinu TSH, aby se potvrdilo, že hodnoty TSH mateřského séra jsou během každého trimestru v referenčním rozsahu pro daný trimestr těhotenství. Zvýšená hladina TSH v séru má být upravena zvýšením dávky levothyroxinu. Vzhledem k tomu, že hladiny TSH po porodu jsou podobné hodnotám před otěhotněním, má se dávka levothyroxinu vrátit k dávce před těhotenstvím ihned po porodu. Hladina TSH v séru se má zkontrolovat 6-8 týdnů po porodu.
Těhotenství Novorozenecký vývoj závisí na funkci štítné žlázy matky. Tyroxin je nezbytný pro vývoj mozku dítěte. Proto musí být kontinuální léčba hormony štítné žlázy udržována zejména během těhotenství. Během těhotenství může být nutné zvýšit dávku. Dosud nebyly hlášeny případná rizika po rozsáhlém používání v těhotenství.
Kojení Levothyroxin se vylučuje do mateřského mléka v období kojení, ale koncentrace dosažené při doporučené terapeutické dávce nejsou dostatečné k tomu, aby způsobily rozvoj hypertyreózy nebo potlačení sekrece TSH u kojenců.
Použití jako podpůrná léčba s tyreostatiky Levothyroxin nemá být podáván spolu s tyreostatickými léky při hypertyreóze v těhotenství a v období kojení. Levothyroxin zvyšuje potřebnou dávku tyreostatik. Protože tyreostatika procházejí placentou snadněji než levothyroxin, kombinovaná terapie může u plodu vyvolat hypotyreózu. Proto se při léčbě hypertyreózy v těhotenství mají používat pouze tyreostatika.