Subchronická a chronická toxicita ibuprofenu se ve studiích na zvířatech projevila hlavně ve formě lézí a vředů v gastrointestinálním traktu. Studie in vitro a in vivo neposkytly žádné klinicky relevantní důkazy o mutagenním potenciálu ibuprofenu. Ve studiích na potkanech a myších nebyl nalezen žádný důkaz karcinogenních účinků. Ibuprofen inhiboval ovulaci u králíků a zhoršoval implantaci embrya u různých druhů zvířat (králík, potkan, myš). Experimentální testy na potkanech a králících ukázaly, že ibuprofen prochází placentou. Po podání dávek toxických pro matku se u potomků potkanů vyskytl zvýšený výskyt malformací (defektů komorového septa).
Ibuprofen může být rizikem pro životní vodní prostředí (viz bod